למרות שערוץ המסחר האלקטרוני מעדיף את ערוץ המכירות הגדול ביותר, בשנים האחרונות קצב הצמיחה של ערוצי המסחר האלקטרוני ירד ל 43%, שהוא רחוק משיעור הצמיחה בשנת 2010. למעשה, מסחר אלקטרוני מזון לחיות מחמד מתמודד כעת קשיים רבים:
ראשית, ההכרה במותג נמוכה: ענף חיות המחמד המקומי החל מאוחר יחסית, עדיין יש חסרונות רציניים בהכרת המותג של מזון לחיות מחמד, וגם תקני איכות המוצר הם כאוטיים, מה שהקשה על טיפוח נאמנות הלקוחות. נכון לעכשיו, למעט כמה מותגי מזון לחיות מחמד ידועים, רוב מותגי המזון לחיות מחמד ביתיים' פיתוח מסחר אלקטרוני לא השיג תוצאות אידיאליות, והשפיע באופן מוגבל על קידום המותג והמוצר.
שנית, התחרות קשה: פלטפורמות המסחר האלקטרוני מלאות במספר גדול של מותגי מזון לחיות מחמד, עם מספר גדול ורמות שונות. מרבית המותגים משיגים בעיקר יתרונות תחרותיים על ידי הורדת מחירים. התחרות בשוק העזה והכאוס מביאים ישירות לרווחי חברות. דחה, משפיע על ההתפתחות שלאחר מכן של המותג.
בנוסף, לערוצים המקוונים יש יתרונות של עלות נמוכה ויעילות גבוהה, שיש להם יתרונות עלות לעומת ערוצים לא מקוונים. עם זאת, ערוצים לא מקוונים הם עדיין אחד הערוצים העיקריים למזון לחיות מחמד. כיצד לאזן את חלוקת ההטבות בין ערוצים מקוונים לא מקוונים ובוחן ישירות את היכולות של יצרני המותג. ויצרנים מקומיים רבים מרבים להתאזן על ידי הפחתת האיכות, וכתוצאה מכך ירידה באיכות המוצר והשפעה שלילית יחסית על המותג, אשר בתורו משפיע על התפתחות המסחר האלקטרוני.

